Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SSPNQ14714 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SSPNQ14714 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SSPNQ14714 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SSPNQ14714 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SSPNQ14714 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SSPNQ14714 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SSPNQ14714 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SSPNQ14714 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SSPNQ14714 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.7 ms