Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RFTN1Q14699 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RFTN1Q14699 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RFTN1Q14699 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.5 ms