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Protein–RNA interactions for Protein: Q14563
SEMA3A, Semaphorin-3A, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SEMA3A
Q14563
RNU6-260P-201
ENST00000384092
107 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
MIR92A1-201
ENST00000385233
78 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
MIR652-201
ENST00000385278
98 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
SNORD110-201
ENST00000408189
75 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
AC006210.1-201
ENST00000424882
111 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
RNU6-881P-201
ENST00000516813
102 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
MIR6755-201
ENST00000619993
66 nt
BASIC
0.57
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.30-201
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97 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
RNU6-539P-201
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103 nt
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
G3BP1-214
ENST00000627077
114 nt
TSL 5
BASIC
0.56
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
RNA5SP347-201
ENST00000362445
119 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
RNU6-663P-201
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106 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
SNORD30.1-201
ENST00000391309
70 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
SNORA40.8-201
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
RNU6-871P-201
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100 nt
BASIC
0.55
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
RNU6-649P-201
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107 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
U6.111-201
ENST00000636093
83 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
AC073869.9-201
ENST00000641610
120 nt
BASIC
0.54
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
SNORA2.1-201
ENST00000363089
137 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.423-201
ENST00000384057
113 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
MIR548E-201
ENST00000408287
88 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
MIR1265-201
ENST00000408444
86 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
MIR4711-201
ENST00000578274
70 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
AC005520.4-201
ENST00000604337
90 nt
BASIC
0.53
□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
MIR8053-201
ENST00000613344
75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.32
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.115-201
ENST00000363272
98 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNU6-645P-201
ENST00000364649
106 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.407-201
ENST00000383986
113 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
MIR518A1-201
ENST00000385068
85 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
TRAJ42-201
ENST00000390495
66 nt
APPRIS P1
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNA5SP193-201
ENST00000410353
107 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
AL157398.1-201
ENST00000452981
186 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNU6-656P-201
ENST00000516785
107 nt
BASIC
0.52
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
MIR5087-201
ENST00000635826
76 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
MIR330-201
ENST00000362196
94 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNU6-800P-201
ENST00000384473
103 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNU6-788P-201
ENST00000390967
104 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
SCARNA17.3-201
ENST00000516381
125 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNA5SP330-201
ENST00000517096
96 nt
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
CCDC7-215
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4158 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
0.51
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNU6-1216P-201
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.125-201
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111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNU6-895P-201
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103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
MIR501-201
ENST00000390204
84 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNU6-630P-201
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
AC098934.3-201
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190 nt
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.633-201
ENST00000459107
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
MIR8087-201
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
Y_RNA.443-201
ENST00000384135
111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
SNORA68.3-201
ENST00000515906
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BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
MIR6739-201
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BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
LINC00345-201
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285 nt
TSL 5
BASIC
0.48
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNU6-229P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
AC090617.8-201
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BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
MIR103A1-201
ENST00000362165
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BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
SNORD44.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
SNORA33.1-201
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130 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
RNU6-590P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
SNORA49-201
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BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
AC021146.9-201
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156 nt
BASIC
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□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
MIR4677-201
ENST00000584153
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BASIC
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SEMA3A
Q14563
AC243829.3-201
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108 nt
BASIC
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SEMA3A
Q14563
UBL4A-207
ENST00000630530
102 nt
TSL 5
BASIC
0.47
□□□□□ -2.33
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.68-201
ENST00000362881
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
SNORD114-4-201
ENST00000363962
75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
SNORA2A-201
ENST00000383885
135 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
RNU6-863P-201
ENST00000515989
104 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
MIR5706-201
ENST00000579841
80 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
MIR3925-201
ENST00000584674
77 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
uc_338.10-201
ENST00000621872
182 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
MIR499B-201
ENST00000636498
73 nt
BASIC
0.46
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
RNA5SP257-201
ENST00000363023
116 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
MIR516B1-201
ENST00000385211
90 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
MIR760-201
ENST00000390220
80 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
RNU6-175P-201
ENST00000516896
107 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
RNU7-188P-201
ENST00000517063
64 nt
BASIC
0.45
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
SNORA63.6-201
ENST00000364921
119 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.340-201
ENST00000365330
92 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.433-201
ENST00000384089
102 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
AC114737.2-201
ENST00000421583
173 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
RN7SL660P-201
ENST00000614852
299 nt
BASIC
0.44
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
SNORA25.4-201
ENST00000363666
124 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.178-201
ENST00000363832
102 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
MIR521-2-201
ENST00000384818
87 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
MIR9-2-201
ENST00000384838
87 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
MIR548AD-201
ENST00000584780
82 nt
BASIC
0.43
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
RNU6-668P-201
ENST00000364180
107 nt
BASIC
0.42
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
KIF20B-201
ENST00000260753
6306 nt
APPRIS P3
TSL 1 (best)
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
RNA5SP128-201
ENST00000365305
116 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
Y_RNA.375-201
ENST00000365625
101 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
SNORA50A-201
ENST00000384225
134 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
MTND4LP1-201
ENST00000446263
157 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
RNU7-129P-201
ENST00000516128
62 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
RNU6-1089P-201
ENST00000516473
104 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
AC243829.6-201
ENST00000612652
106 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
U2.7-201
ENST00000619197
100 nt
BASIC
0.41
□□□□□ -2.34
SEMA3A
Q14563
AC090625.1-201
ENST00000357130
210 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
SEMA3A
Q14563
MIRLET7D-201
ENST00000362263
87 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
SEMA3A
Q14563
VTRNA1-3-201
ENST00000365645
89 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
SEMA3A
Q14563
RNU6-471P-201
ENST00000383944
106 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
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