Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SEMA3AQ14563 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SEMA3AQ14563 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SEMA3AQ14563 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3AQ14563 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3AQ14563 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SEMA3AQ14563 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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