Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NR1D1P20393 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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NR1D1P20393 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
NR1D1P20393 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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NR1D1P20393 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NR1D1P20393 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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