Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
J3KT08 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
J3KT08 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
J3KT08 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
J3KT08 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
J3KT08 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
J3KT08 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
J3KT08 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
J3KT08 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
J3KT08 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
J3KT08 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
J3KT08 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
J3KT08 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
J3KT08 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
J3KT08 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
J3KT08 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
J3KT08 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
J3KT08 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.84□□□□□ -2.86
J3KT08 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
J3KT08 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
J3KT08 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
J3KT08 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
J3KT08 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
J3KT08 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
J3KT08 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
J3KT08 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
J3KT08 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
J3KT08 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
J3KT08 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-2.87□□□□□ -2.87
J3KT08 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
J3KT08 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
J3KT08 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
J3KT08 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
J3KT08 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
J3KT08 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-2.88□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
J3KT08 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
J3KT08 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
J3KT08 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
J3KT08 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
J3KT08 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
J3KT08 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
J3KT08 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
J3KT08 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
J3KT08 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
J3KT08 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
J3KT08 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
J3KT08 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
J3KT08 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
J3KT08 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.92□□□□□ -2.88
J3KT08 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
J3KT08 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
J3KT08 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
J3KT08 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
J3KT08 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
J3KT08 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
J3KT08 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
J3KT08 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
J3KT08 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
J3KT08 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
J3KT08 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
J3KT08 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
J3KT08 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
J3KT08 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
J3KT08 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
J3KT08 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
J3KT08 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
J3KT08 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
J3KT08 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
J3KT08 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
J3KT08 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
J3KT08 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
J3KT08 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
J3KT08 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
J3KT08 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
J3KT08 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
J3KT08 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
J3KT08 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
J3KT08 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
J3KT08 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
J3KT08 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
J3KT08 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
J3KT08 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
J3KT08 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
J3KT08 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
J3KT08 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 368.8 ms