Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CNGA3Q16281 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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CNGA3Q16281 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CNGA3Q16281 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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CNGA3Q16281 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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CNGA3Q16281 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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CNGA3Q16281 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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CNGA3Q16281 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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CNGA3Q16281 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CNGA3Q16281 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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