Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NKX1-1Q15270 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NKX1-1Q15270 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
NKX1-1Q15270 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NKX1-1Q15270 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NKX1-1Q15270 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NKX1-1Q15270 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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