Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
LAPTM4AQ15012 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LAPTM4AQ15012 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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