Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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GBX1Q14549 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GBX1Q14549 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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GBX1Q14549 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
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GBX1Q14549 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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GBX1Q14549 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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GBX1Q14549 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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GBX1Q14549 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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GBX1Q14549 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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GBX1Q14549 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GBX1Q14549 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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GBX1Q14549 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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GBX1Q14549 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
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GBX1Q14549 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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