Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCARB2Q14108 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCARB2Q14108 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCARB2Q14108 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SCARB2Q14108 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
SCARB2Q14108 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SCARB2Q14108 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
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SCARB2Q14108 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
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SCARB2Q14108 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
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SCARB2Q14108 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SCARB2Q14108 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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SCARB2Q14108 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCARB2Q14108 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
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