Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
KLF9Q13886 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
KLF9Q13886 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
KLF9Q13886 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.2 ms