Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ZNF543Q08ER8 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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ZNF543Q08ER8 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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ZNF543Q08ER8 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ZNF543Q08ER8 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
ZNF543Q08ER8 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
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