Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
EPHB4P54760 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EPHB4P54760 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
EPHB4P54760 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
EPHB4P54760 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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