Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
SCN11AQ9UI33 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-3.25□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-3.28□□□□□ -2.93
SCN11AQ9UI33 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-3.29□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.3□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-3.31□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
SCN11AQ9UI33 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-3.32□□□□□ -2.94
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