Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HOXC10Q9NYD6 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HOXC10Q9NYD6 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HOXC10Q9NYD6 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HOXC10Q9NYD6 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HOXC10Q9NYD6 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HOXC10Q9NYD6 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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