Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ATG4CQ96DT6 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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ATG4CQ96DT6 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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ATG4CQ96DT6 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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ATG4CQ96DT6 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATG4CQ96DT6 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ATG4CQ96DT6 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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ATG4CQ96DT6 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ATG4CQ96DT6 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ATG4CQ96DT6 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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ATG4CQ96DT6 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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ATG4CQ96DT6 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATG4CQ96DT6 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATG4CQ96DT6 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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