Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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USP53Q70EK8 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP53Q70EK8 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP53Q70EK8 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP53Q70EK8 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP53Q70EK8 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP53Q70EK8 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP53Q70EK8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP53Q70EK8 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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USP53Q70EK8 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
USP53Q70EK8 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
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USP53Q70EK8 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USP53Q70EK8 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USP53Q70EK8 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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USP53Q70EK8 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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USP53Q70EK8 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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USP53Q70EK8 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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USP53Q70EK8 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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USP53Q70EK8 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
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USP53Q70EK8 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USP53Q70EK8 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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USP53Q70EK8 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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