Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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SGCAQ16586 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SGCAQ16586 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SGCAQ16586 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SGCAQ16586 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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SGCAQ16586 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SGCAQ16586 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SGCAQ16586 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SGCAQ16586 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SGCAQ16586 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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SGCAQ16586 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SGCAQ16586 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SGCAQ16586 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
SGCAQ16586 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
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SGCAQ16586 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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SGCAQ16586 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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SGCAQ16586 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SGCAQ16586 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
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SGCAQ16586 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
SGCAQ16586 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
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SGCAQ16586 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SGCAQ16586 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SGCAQ16586 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
SGCAQ16586 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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SGCAQ16586 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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SGCAQ16586 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SGCAQ16586 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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