Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
CCDC85BQ15834 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CCDC85BQ15834 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CCDC85BQ15834 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC85BQ15834 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.3 ms