Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SF1Q15637 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SF1Q15637 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SF1Q15637 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SF1Q15637 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SF1Q15637 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SF1Q15637 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SF1Q15637 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SF1Q15637 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SF1Q15637 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SF1Q15637 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SF1Q15637 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SF1Q15637 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SF1Q15637 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SF1Q15637 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SF1Q15637 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SF1Q15637 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SF1Q15637 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SF1Q15637 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SF1Q15637 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SF1Q15637 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SF1Q15637 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SF1Q15637 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SF1Q15637 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SF1Q15637 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SF1Q15637 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SF1Q15637 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SF1Q15637 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SF1Q15637 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SF1Q15637 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SF1Q15637 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SF1Q15637 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SF1Q15637 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SF1Q15637 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SF1Q15637 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
SF1Q15637 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SF1Q15637 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SF1Q15637 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SF1Q15637 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SF1Q15637 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SF1Q15637 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SF1Q15637 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SF1Q15637 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SF1Q15637 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SF1Q15637 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SF1Q15637 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SF1Q15637 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SF1Q15637 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SF1Q15637 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SF1Q15637 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
SF1Q15637 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SF1Q15637 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SF1Q15637 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SF1Q15637 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SF1Q15637 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SF1Q15637 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SF1Q15637 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.6 ms