Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RAPGEF1Q13905 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RAPGEF1Q13905 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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