Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TNFAIP1Q13829 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TNFAIP1Q13829 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TNFAIP1Q13829 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TNFAIP1Q13829 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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TNFAIP1Q13829 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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TNFAIP1Q13829 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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TNFAIP1Q13829 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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TNFAIP1Q13829 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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TNFAIP1Q13829 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TNFAIP1Q13829 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TNFAIP1Q13829 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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