Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PTPN13Q12923 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PTPN13Q12923 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.8 ms