Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXA4Q00056 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXA4Q00056 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
HOXA4Q00056 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.2 ms