Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ATG4CQ96DT6 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ATG4CQ96DT6 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ATG4CQ96DT6 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249 ms