Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LINC00612Q8N6U2 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LINC00612Q8N6U2 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LINC00612Q8N6U2 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LINC00612Q8N6U2 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LINC00612Q8N6U2 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LINC00612Q8N6U2 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LINC00612Q8N6U2 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LINC00612Q8N6U2 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LINC00612Q8N6U2 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
LINC00612Q8N6U2 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
LINC00612Q8N6U2 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
LINC00612Q8N6U2 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224 ms