Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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CNGA3Q16281 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CNGA3Q16281 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNGA3Q16281 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNGA3Q16281 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNGA3Q16281 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNGA3Q16281 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNGA3Q16281 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CNGA3Q16281 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CNGA3Q16281 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNGA3Q16281 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CNGA3Q16281 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
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