Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PRKD1Q15139 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PRKD1Q15139 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PRKD1Q15139 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.2 ms