Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
DSC3Q14574 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
DSC3Q14574 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
DSC3Q14574 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.8 ms