Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
COL9A2Q14055 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
COL9A2Q14055 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
COL9A2Q14055 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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