Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CNGB1Q14028 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNGB1Q14028 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNGB1Q14028 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.8 ms