Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
KLF9Q13886 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202 ms