Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
NFX1Q12986 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
NFX1Q12986 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NFX1Q12986 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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