Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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