Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APAF1O14727 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APAF1O14727 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APAF1O14727 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APAF1O14727 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
APAF1O14727 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APAF1O14727 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
APAF1O14727 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
APAF1O14727 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
APAF1O14727 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
APAF1O14727 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
APAF1O14727 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
APAF1O14727 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
APAF1O14727 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
APAF1O14727 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
APAF1O14727 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
APAF1O14727 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
APAF1O14727 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
APAF1O14727 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
APAF1O14727 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
APAF1O14727 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
APAF1O14727 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
APAF1O14727 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APAF1O14727 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APAF1O14727 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APAF1O14727 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
APAF1O14727 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APAF1O14727 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APAF1O14727 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0□□□□□ -2.41
APAF1O14727 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APAF1O14727 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APAF1O14727 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APAF1O14727 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APAF1O14727 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
APAF1O14727 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
APAF1O14727 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APAF1O14727 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APAF1O14727 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APAF1O14727 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APAF1O14727 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
APAF1O14727 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APAF1O14727 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APAF1O14727 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APAF1O14727 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APAF1O14727 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APAF1O14727 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APAF1O14727 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APAF1O14727 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APAF1O14727 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APAF1O14727 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APAF1O14727 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.4 ms