Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

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Length 881 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKP2Q99959 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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PKP2Q99959 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKP2Q99959 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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