Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PRRT1Q99946 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PRRT1Q99946 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
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