Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNMB1Q16558 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KCNMB1Q16558 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KCNMB1Q16558 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
KCNMB1Q16558 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
KCNMB1Q16558 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.1 ms