Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SF1Q15637 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SF1Q15637 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SF1Q15637 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SF1Q15637 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SF1Q15637 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SF1Q15637 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF1Q15637 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF1Q15637 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF1Q15637 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SF1Q15637 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SF1Q15637 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SF1Q15637 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SF1Q15637 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SF1Q15637 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SF1Q15637 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SF1Q15637 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF1Q15637 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF1Q15637 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF1Q15637 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SF1Q15637 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF1Q15637 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF1Q15637 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF1Q15637 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF1Q15637 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF1Q15637 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF1Q15637 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF1Q15637 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SF1Q15637 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF1Q15637 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF1Q15637 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF1Q15637 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SF1Q15637 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
SF1Q15637 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF1Q15637 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF1Q15637 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF1Q15637 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF1Q15637 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF1Q15637 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SF1Q15637 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SF1Q15637 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SF1Q15637 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SF1Q15637 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SF1Q15637 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SF1Q15637 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SF1Q15637 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SF1Q15637 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SF1Q15637 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SF1Q15637 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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