Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
NKX1-1Q15270 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NKX1-1Q15270 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NKX1-1Q15270 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NKX1-1Q15270 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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