Protein–RNA interactions for Protein: Q13671

RIN1, Ras and Rab interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN1Q13671 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RIN1Q13671 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RIN1Q13671 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.5 ms