Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TOP3AQ13472 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TOP3AQ13472 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TOP3AQ13472 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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