Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NFX1Q12986 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
NFX1Q12986 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
NFX1Q12986 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFX1Q12986 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms