Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
FOXC1Q12948 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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FOXC1Q12948 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
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FOXC1Q12948 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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FOXC1Q12948 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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FOXC1Q12948 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXC1Q12948 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
FOXC1Q12948 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXC1Q12948 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXC1Q12948 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXC1Q12948 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXC1Q12948 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXC1Q12948 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXC1Q12948 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXC1Q12948 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXC1Q12948 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXC1Q12948 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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