Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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SNX13Q9Y5W8 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNX13Q9Y5W8 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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SNX13Q9Y5W8 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNX13Q9Y5W8 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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SNX13Q9Y5W8 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX13Q9Y5W8 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX13Q9Y5W8 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX13Q9Y5W8 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX13Q9Y5W8 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNX13Q9Y5W8 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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