Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP1Q9Y3L3 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.1 ms