Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RABGEF1Q9UJ41 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
RABGEF1Q9UJ41 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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