Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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NIPSNAP3AQ9UFN0 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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