Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
EHD3Q9NZN3 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
EHD3Q9NZN3 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
EHD3Q9NZN3 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.7 ms