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Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1
TPRN, Taperin, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
TPRN
Q4KMQ1
SNORA31.24-201
ENST00000517232
57 nt
BASIC
1.66
□□□□□ -2.14
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-1244P-201
ENST00000363614
108 nt
BASIC
1.65
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
MIR608-201
ENST00000384820
100 nt
BASIC
1.65
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-972P-201
ENST00000391208
107 nt
BASIC
1.65
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
SNORA40.13-201
ENST00000516379
120 nt
BASIC
1.65
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
MIR4421-201
ENST00000578133
69 nt
BASIC
1.65
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
AC011195.1-201
ENST00000578177
177 nt
BASIC
1.65
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
MIR3612-201
ENST00000579753
87 nt
BASIC
1.65
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
SNORD63B-201
ENST00000411005
70 nt
BASIC
1.64
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
AC244098.3-201
ENST00000424803
96 nt
BASIC
1.64
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
AC097635.1-201
ENST00000450678
155 nt
BASIC
1.64
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
AC092892.1-201
ENST00000496067
327 nt
TSL 5
BASIC
1.64
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
AL078603.1-201
ENST00000603824
313 nt
BASIC
1.64
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-86P-201
ENST00000606534
107 nt
BASIC
1.64
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
MIR6734-201
ENST00000621166
68 nt
BASIC
1.64
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
AC012531.4-201
ENST00000616509
177 nt
BASIC
1.63
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
AP001318.4-201
ENST00000616637
121 nt
BASIC
1.63
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.191-201
ENST00000363972
113 nt
BASIC
1.62
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-1254P-201
ENST00000391266
104 nt
BASIC
1.62
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-795P-201
ENST00000516323
103 nt
BASIC
1.62
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
MIR4777-201
ENST00000583710
86 nt
BASIC
1.62
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
AC091304.10-201
ENST00000641554
121 nt
BASIC
1.62
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
MGAT4C-209
ENST00000611864
25116 nt
APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.61
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
AC244505.6-201
ENST00000452829
130 nt
BASIC
1.61
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
TRAJ51-201
ENST00000504127
63 nt
BASIC
1.61
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
SNORA31.14-201
ENST00000516728
116 nt
BASIC
1.61
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.32-201
ENST00000362589
110 nt
BASIC
1.6
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
RNU1-123P-201
ENST00000458950
160 nt
BASIC
1.6
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-109P-201
ENST00000516364
107 nt
BASIC
1.6
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-184P-201
ENST00000516514
107 nt
BASIC
1.6
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
AL353770.2-201
ENST00000620024
78 nt
BASIC
1.6
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
MTATP8P2-201
ENST00000435212
202 nt
BASIC
1.59
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
MIR4452-201
ENST00000583004
71 nt
BASIC
1.59
□□□□□ -2.15
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-110P-201
ENST00000384508
104 nt
BASIC
1.58
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-243P-201
ENST00000391140
107 nt
BASIC
1.58
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
AC211469.2-201
ENST00000605461
205 nt
BASIC
1.58
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
MIR7974-201
ENST00000615835
79 nt
BASIC
1.58
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-887P-201
ENST00000410660
100 nt
BASIC
1.57
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.809-201
ENST00000516058
95 nt
BASIC
1.57
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-168P-201
ENST00000516189
101 nt
BASIC
1.57
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP102-201
ENST00000516865
106 nt
BASIC
1.57
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
MIR6078-201
ENST00000611069
100 nt
BASIC
1.57
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
FAM135A-203
ENST00000370479
5930 nt
TSL 1 (best)
BASIC
1.56
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-1260P-201
ENST00000362944
107 nt
BASIC
1.56
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-42P-201
ENST00000384165
107 nt
BASIC
1.56
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.467-201
ENST00000384297
102 nt
BASIC
1.56
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.677-201
ENST00000516401
85 nt
BASIC
1.56
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
IGLVVI-22-1-201
ENST00000521183
211 nt
BASIC
1.56
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
MIR516A2-201
ENST00000384888
90 nt
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
MIR181B2-201
ENST00000385004
89 nt
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
MIR516A1-201
ENST00000385033
90 nt
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-644P-201
ENST00000391155
98 nt
BASIC
1.55
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
MIR18A-201
ENST00000362310
71 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP220-201
ENST00000516298
104 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
ST7-AS2_1.1-201
ENST00000622900
72 nt
BASIC
1.54
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
MIR599-201
ENST00000385069
95 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
MIR4639-201
ENST00000584938
69 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
AC103810.7-201
ENST00000607821
91 nt
BASIC
1.53
□□□□□ -2.16
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP245-201
ENST00000364239
121 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-1229P-201
ENST00000364295
107 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
ACA64.5-201
ENST00000516207
127 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
AC068338.1-201
ENST00000565567
176 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
ST7-OT3_3.1-201
ENST00000611709
115 nt
BASIC
1.52
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP222-201
ENST00000411039
105 nt
BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
RNU7-195P-201
ENST00000458793
62 nt
BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
MIR3678-201
ENST00000578455
94 nt
BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
FAM19A1-204
ENST00000617084
159 nt
TSL 5
BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
NEAT1_2.1-201
ENST00000620525
105 nt
BASIC
1.51
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
SNORD36A-201
ENST00000362874
73 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
SNORD116-10-201
ENST00000363791
102 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.348-201
ENST00000365403
103 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
AL162399.1-201
ENST00000426090
130 nt
TSL 3
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
RNU7-106P-201
ENST00000459514
67 nt
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
AC087277.2-201
ENST00000533203
151 nt
TSL 5
BASIC
1.5
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
RNA5SP89-201
ENST00000410300
108 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
RNU7-61P-201
ENST00000515897
61 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
MIR548Z-201
ENST00000584743
97 nt
BASIC
1.49
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
SNORD114-22-201
ENST00000365423
72 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
TPRN
Q4KMQ1
SNORD58A-201
ENST00000383875
65 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
MIR7-2-201
ENST00000384970
110 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
MIR644A-201
ENST00000385262
94 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
MIR758-201
ENST00000390227
88 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
AL513043.2-201
ENST00000573941
143 nt
BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.648-201
ENST00000459455
110 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
AC004223.1-201
ENST00000479840
271 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
Y_RNA.694-201
ENST00000516677
117 nt
BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
SNORD115-24-201
ENST00000363528
82 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
SNORD18A-201
ENST00000363753
72 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-466P-201
ENST00000391224
103 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
PSMC1P5-201
ENST00000512850
177 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
ZNRD1-AS1_1.6-201
ENST00000610339
68 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
AC025521.1-201
ENST00000621624
286 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
VPS35-212
ENST00000640313
141 nt
TSL 5
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
SNORD28-201
ENST00000384706
75 nt
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
MIR4653-201
ENST00000585107
83 nt
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-905P-201
ENST00000384434
107 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
U7.3-201
ENST00000616123
62 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
TPRN
Q4KMQ1
SNORA36.2-201
ENST00000384004
127 nt
BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
TPRN
Q4KMQ1
RNU6-524P-201
ENST00000384270
107 nt
BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
TPRN
Q4KMQ1
MIR3660-201
ENST00000584845
100 nt
BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
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